تضم جامعة هليوبوليس للتنمية المستدامة خمس كليات تمنح الدرجة العلمية الأولى وهي:

كلية الهندسة

كلية الإدارة والاقتصاد

كلية الصيدلة وتكنولوجيا الدواء

كلية العلاج الطبيعي

كلية الزراعة الحيوية

تقدم الكليات الخمس نماذج جديدة في الإدارة والاقتصاد وحلول هندسية مبدعة وتطبيقات مستحدثة للزراعة الحيوية ورعاية صحية شاملة. ويوجه التدريس نحو التنمية المستدامة عبر منهج ديناميكي متقدم تم وضعه بالتعاون مع شركاء تربويين دوليين ومؤسسات بحثية.

وتهيئ الكليات الخمس بيئة تعلمية حديثة ومثالية ذات معايير مرتفعة، حيث توفر ما يلي:

 بنية تحتية وتعليمية حديثة

أعضاء هيئة تدريس ومعاونين متميزين

أعداد محدودة من الطلبة

ًفصول مجهزة  تكنولوجيا

معامل عالية التقنية

برامج تبادل طلابي مرموقة

جميع برامج الدرجات الجامعية معتمدة ومعترف بها من جانب وزارة التعليم العالي المصرية وقائمة على نظام الساعات المعتمدة و متوافقة مع نظام تحويل الساعات المعتمدة الأوروبي ECTS. كما تؤهل هذه البرامج جميع الخريجين للعمل على القضايا البيئية بصورة خاصة في جميع المجالات، كما يؤهلون لمواصلة  الدراسات العليا في مصر وخارجها.